七夕成人色情网 对于seurat作图VlnPlot小提琴图横坐标端正的修改

发布日期:2025-07-03 23:29    点击次数:75

七夕成人色情网 对于seurat作图VlnPlot小提琴图横坐标端正的修改

3、付费著述勾搭有打包价哦!七夕成人色情网

笃定请关联作家:

巴黎世家 丝袜

前边咱们作念了一个Split小提琴图的函数(ggplot堆叠图无缝拼接(自写一个玩忽堆叠小提琴图函数))。有小伙伴在践诺中淡薄了问题,即是横坐标细胞类型celltype的端正是默许摆设的,何如按照我方的条件进行排序,商榷修改函数的面貌。其实这个问题是VlnPlot作念的通用问题七夕成人色情网,和这个函数无关。咱们最初作念一个图:

library(Seurat)library(dittoSeq)library(ggplot2)library(ggpubr)makers <- c('Ltf',"Ngp",'Ccl6','Srgn','S100a9','Mmp8',            'Cstdc4', "Ccl6",'Il1b','Chn2','Stfa2l1',            'Retnlg','Olfm4','Cd177','Top2a','Stmn1')Split_Vln_stacked(mouse_data, feature = makers, split.by = 'orig.ident',                  split.plot = T, pt.size = 0, size = 10,                   cols = c("limegreen", "navy"),                  sig_label = 'p.signif',test = T,test_method = 't.test')

图片

其实问题的实践是固定因子端正,咱们之前在ggplot作图的时刻屡次说起。

unique(Idents(mouse_data))# [1] PMN(3) PMN(2) PMN(1) PMN(0) PMN(5) PMN(6) PMN(4) PMN(7)# Levels: PMN(0) PMN(1) PMN(2) PMN(3) PMN(4) PMN(5) PMN(6) PMN(7)cell_levels <- c("PMN(7)","PMN(6)","PMN(5)","PMN(4)",                 "PMN(3)","PMN(2)","PMN(1)","PMN(0)")Idents(mouse_data) <- factor(Idents(mouse_data), levels= cell_levels)Split_Vln_stacked(mouse_data, feature = makers, split.by = 'orig.ident',                  split.plot = T, pt.size = 0, size = 10,                   cols = c("limegreen", "navy"),                  sig_label = 'p.signif',test = T,test_method = 't.test')

图片

这么就不错开合自由展示我方细胞类型端正了七夕成人色情网。合计共享有效的点个赞、共享下再走呗!

本站仅提供存储工作,系数内容均由用户发布,如发现存害或侵权内容,请点击举报。

栏目分类
热点资讯
相关资讯